Начиная с середины 1990-х годов Музей постоянно сотрудничает с кинематофографистами и работниками телевидения, как России, так и ряда зарубежных стран (Финляндии, Китая, Монголии). Сотрудники музея-квартиры принимали непосредственное участие (подбор архивных материалов, помощь в написании сценариев, интервью) в создании следующих документальных фильмов и передач:
- В 2003 году на только что открытой экспозиции музея прошли съёмки 26-минутного документального фильма для серии «Петербург: время и место» на телеканале “Культура”. Ведущим выступил народный артист России Андрей Юрьевич Толубеев.
- В 2013 году (год 150-летия П.К. Козлова) музей-квартира путешественника “снялась в главной роли” в одном из эпизодов документального сериала «Не квартира – музей!». Сценарист и ведущий: Иннокентий Иванов.
- В феврале 2016 года сюжет о П. К. Козлове, снятый в Музее, вошёл в цикл передач, которые телеканал «Культура» посвятил истории Первой Мировой войны, – «На этой неделе… 100 лет назад. Нефронтовые заметки».
- В декабре 2017 г. на телеканале НТВ состоялась премьера фильма Владимира Шуванникова и Татьяны Борщ «Пётр Козлов. Тайна затерянного города». В фильм вошли игровые эпизоды, снятые в музее, и фрагменты интервью с Александром Ивановичем Андреевым.
- В 2024 г. на телеканале «Культура» вышел выпуск авторской программы директора Государственного Эрмитажа Михаила Борисовича Пиотровского «В поисках хунну». Фильм приурочен к открытию выставки “Археологический феномен. Между прошлым и будущим” (к 100-летию открытий в Ноин-Уле).
- Летом 2024 г. в музее-квартире проходили съёмки эпизодов документального фильма «Разведчик от науки: Пётр Козлов» серии “Люди РФ” телеканала “Вместе РФ”. Сценарий: Наталья Иринина, режиссёр: Наталья Обознова.
- В ноябре 2024 года состоялась премьера экспериментального документально-игрового фильма для молодёжной аудитории «Пётр Козлов: Путь к сердцу Азии». Режиссёр: Николай Макаров, продюсеры: Лариса Базылевич и Георгий Рыков.
- В марте 2025 г. на телеканале “Культура” в рамках цикла “Невский ковчег” состоялась премьера фильма «Пётр Козлов: Ключи от тайн земли». Сценарий: Анастасия Тамило, режиссёр: Наталия Чернышова. Ведущий – народный артист России Николай Витальевич Буров.